Самаркандский областной центр государственного санитарно-эпидемиологического контроля был создан в 1940 году под названием «Санитарно-эпидемиологическая станция Самаркандской области»
В 1955-1956 гг. организация была переведена в двухэтажное здание, расположенное по адресу: ул. Исаева, 40, Самарканд.
Здание оснащено современным медицинским оборудованием.