Профессиональный союз является общественным объединением граждан, связанных общими интересами по роду их деятельности в производственной и непроизводственной сферах для защиты трудовых и иных социально-экономических прав и законных интересов своих членов.
С первых дней независимости Узбекистана, в новых условиях политической, социальной и экономической жизни республики, особое внимание было уделено развитию негосударственных некоммерческих организаций. Одним из первых Законов, принятых после приобретения независимости, был Закон «0 профессиональных союзах, правах и гарантиях их деятельности», которым определен юридический статус этой самой массовой общественной организации в стране.
Коренным образом изменились и направления деятельности профсоюзных организаций в соответствии с программными документами, принимаемыми Курултаями Федерации.
Федерация профсоюзов Узбекистана участвует на экспертном уровне в разработке проектов законов и нормативно-правовых актов, касающихся социально-трудовой сферы, соблюдения прав трудящихся и профсоюзов.
Одной из наиболее важных функций Федерации профсоюзов Узбекистана стала усиление социального партнерства, участие в работе Республиканской трехсторонней комиссии по социальному партнерству и регулированию социально-экономических и трудовых отношений.
В целях усиления со стороны профсоюзов социально-экономической защиты молодёжи, обучающихся в высших и средне-специальных образовательных учреждениях, работающих на предприятиях, в организациях, а также женщин, обеспечения системной работы с ними при Совете Федерации профсоюзов созданы Молодёжный и Женский Советы.
Проводится целенаправленная работа по содействию обеспечения занятости населения, в рамках которой профсоюзы принимают участие в изучении подлинность создания новых рабочих мест. Разработан и осуществляется комплекс мер по участию профсоюзов в обеспечении занятости населения и трудоустройстве выпускников профессиональных колледжей.